Ο πόνος είναι το πρώτο πράγμα που έρχεται στο μυαλό του ασθενή όταν αναφερόμαστε στη λέξη απονεύρωση, για αυτό συνήθως και καθυστερούν την έλευση τους στο οδοντιατρείο γεγονός που επιδεινώνει την κατάσταση.  Ωστόσο

η αντίληψη πως η απονεύρωση είναι  επώδυνη  σχετίζεται κυρίως με τον ανυπόφορο πόνο που αισθάνονται πριν από τη θεραπεία εξαιτίας της μόλυνσης του δοντιού και του αποστήματος, και όχι στην επέμβαση της απονεύρωσης. Είναι αλήθεια πως πριν από κάποια χρόνια η απονεύρωση ήταν μια οδυνηρή διαδικασία. Σήμερα όμως με τα διάφορα μέσα που διαθέτουμε έχει αλλάξει η τεχνική της ενδοδοντικής θεραπείας και έχει μειωθεί σημαντικά ο πόνος. Εξαιρείται βέβαια η περίπτωση όπου υπάρχει έντονη φλεγμονή στο δόντι και η τοπική αναισθησία μπορεί να αποδειχθεί αναποτελεσματική. Η φλεγμονή μειώνει την κυκλοφορία του αίματος στο δόντι οπότε και το αναισθητικό δε μπορεί να φτάσει και να μουδιάσει το δόντι. Έτσι, απαιτείται αύξηση της δόσης του αναισθητικού. Σε γενικές γραμμές όμως πλέον η ενδοδοντική θεραπεία αποτελεί μια απλή και ανώδυνη διαδικασία.